天皇伏羲氏，地皇神农氏归隐，人族进入群雄并起的时代。有熊部落的轩辕，得武祖化身根基，天命所钟，更兼胸怀大志，文韬武略。他一方面整顿部落，发展农耕，演练兵法，推广仓颉所造文字，制定历法律令；另一方面，广纳贤才，结交四方部落，威望日隆。
然而，其统一之路的最大阻碍，便是雄踞东南、以勇猛善战着称的九黎部落联盟及其首领蚩尤。蚩尤乃祖巫本源转世，铜头铁额，刀枪不入，更能呼风唤雨，驱策猛兽妖魔，其麾下八十一兄弟（亦为巫人强者）个个骁勇，所向披靡。两大势力摩擦不断，大战一触即发。
轩辕深知蚩尤强悍，单凭有熊一部难以抗衡。他采取了两项关键战略：
1. 联合炎帝：当时尚有另一大部落联盟，首领为炎帝（神农氏后代，一支姜姓部落首领），实力雄厚。轩辕不以力压，而以德服，陈说利害，最终与炎帝结盟，共尊轩辕为主，炎帝为副，史称“炎黄联盟”，实力大增。
2. 借助外力：轩辕坦然接受天庭与龙界的援助。九天玄女传授其兵法阵图（如八阵图）、指南车制法；应龙率龙族精英助阵，可飞天布雨，亦可陆地搏杀；另有风伯、雨师等散修能人异士来投。
反观蚩尤，虽勇猛无双，却过于依赖个人武力与巫族血脉，统治方式较为原始粗暴，未能有效整合麾下所有部落，且与周边部落关系紧张，树敌颇多。
决战之地，选在了地势开阔、关乎中原气运的逐鹿之野！
这一日，战云密布，杀气冲天！
轩辕一方，炎黄联军阵型严谨，旌旗招展，刀枪如林，更有应龙盘旋于空，玄女督战于后，气势如虹。
蚩尤一方，九黎大军煞气凝聚，蛮荒之气扑面而来，蚩尤本人手持巨斧（伴生巫器），坐骑食铁兽（熊猫？），八十一兄弟各显神通，更有召唤来的毒雾瘴气、山精野怪助阵，凶威赫赫！
大战爆发！
蚩尤一马当先，冲入敌阵，所向披靡，斧光过处，人仰马翻！其八十一兄弟亦凶猛异常，炎黄联军一时损失惨重。
轩辕临危不乱，指挥若定，以玄女所传阵法应对，分化包围，步步为营。应龙腾空，兴云布雨，冲刷毒瘴，亦与蚩尤召唤来的风伯雨师斗法！
关键时刻，轩辕亲持一把采首山之铜、集众力锻造的宝剑（尚无名），身先士卒，与蚩尤展开惊天动地的王者对决！剑光与斧影交错，武道意志与祖巫战意碰撞，打得山崩地裂，江河倒流！
然而，蚩尤肉身实在太强，轩辕虽勇，亦难破防。久战之下，联军渐显疲态。
就在此时，九天玄女祭出法宝，扰乱蚩尤心神；应龙找准机会，一口龙息喷出，灼伤蚩尤坐骑；炎帝亦率部从侧翼猛攻，搅乱九黎阵脚！蚩尤分心之下，被轩辕抓住破绽，凝聚全身武道修为与人皇气运，一剑斩出！
“轩辕剑法——定鼎天下！”
煌煌剑光，蕴含武祖真意与人道秩序，仿佛携带着整个人族的意志，斩破了蚩尤的护体煞气，在其胸前留下一道深可见骨的伤口！蚩尤怒吼，败象已露！
九黎大军见首领受创，士气大跌，溃败如山倒。八十一兄弟或被斩杀，或被擒拿。蚩尤虽勇，亦知大势已去，怒吼一声，率残部突围而去。
逐鹿之战，轩辕胜！
此战定鼎，轩辕威望达到顶峰，四方部落纷纷归附。他乘胜追击，平定四方，最终统一人族，被尊为黄帝！定都于有熊，划野分州，设官定制，创礼乐，制衣冠，建舟车，定算数，人族文明进入了一个前所未有的大一统时代，制度完备，文化昌明！
天道感应其一统人族、开创文明盛世的无量功德，降下浩瀚功德金光，比之伏羲画卦、神农尝草亦不遑多让！
功德加身，轩辕黄帝修为暴涨！其体内武祖化身的本源彻底苏醒、融合！他并未选择立教或发宏愿，而是以人道共主之身，汇聚整个人族的气运与信仰，结合自身武道修为与治理功德，凝聚出一枚象征着人族大一统、文明秩序的独特道果——半步混元道果（亚圣）！其威能、地位，与地皇神农氏相当！
同时，他手中那柄随他征战、承载了人皇气运与征伐功德的宝剑，受功德洗礼，化为后天功德至宝，剑身一面刻日月星辰，一面刻山川草木，剑柄书农耕畜养之术，四海统一之策，散发着平定天下、守护苍生的无上威严，是为——轩辕剑！
关于“御女三千”之说，后世多有附会。实则乃轩辕黄帝为融合各族、促进血脉交流、巩固统一，广泛与各部落联姻，其后宫确有众多妃嫔，象征人族大融合。此事亦暗合阴阳调和之道，对其稳固人皇气运、圆满道果，确有助益，但并非其证道之核心。
功德圆满，道果已成，轩辕黄帝知人间使命已了，将帝位禅让于贤能的少昊，而后在万民朝拜中，携轩辕剑，乘龙飞升，直入火云洞，与天皇伏羲、地皇神农、以及人族三祖（燧人氏、有巢氏、缁衣氏）汇合，共同镇压人族气运，为人族至高精神象征！自此，三皇五帝之火云洞体系，初步奠定！
而败走的蚩尤，虽战场失利，却也在转世为人、亲身参与这场席卷人族的大劫后，其祖巫本源与巫人血脉彻底融合、激发，原本细微的瑕疵得以弥补，祖巫真身趋于圆满无瑕！他退回巫界，被十二祖巫接纳，实力更胜往昔！虽未能争得人皇之位，但于其个人而言，亦是得了大机缘。巫界也因此与人族（尤其是九黎后裔）结下更深的因果羁绊。
逐鹿之战，标志着三皇时代的终结与五帝时代的开启。人族在经历了天皇启蒙、地皇生养、人皇一统后，真正成为了一个团结、强大、文明鼎盛的洪荒主角种族！
洪荒诸位大能，见证此役，皆有所感：
天庭、龙界因投资成功，分润功德，气运稳固。
诸圣见人道昌隆，各自道统传播亦得便利。
混元大能们则对“人道证道”之路有了更深理解。
段风（无涯道人）坐镇紫微垣，看着人族一步步走向辉煌，心中欣慰。他的“武祖”化身功德圆满，抽象大道与人道气运联系更加紧密。而他暗中布局的“地球试验场”，其上的文明进程，似乎也即将进入一个关键的节点……
洪荒的人族纪元，翻开了崭新的一页。而更多的故事，还在这片古老的土地上，以及那无垠的星海之中，悄然上演。