共生联邦的「贪婪之罪」号星舰完成首航的第七个宇宙日，陆辰正在舰桥调试「文明灯塔」系统，荧光草的光影在他掌心流淌成星图。突然，圣物碎片剧烈震颤，碎片表面的共生图腾竟如蛛网般龟裂，露出底下暗红的熵寂纹路 —— 那是三年前虚数议会崩塌时他亲手封存的能量残片。林小棠的基因共鸣几乎同时响起警报，她看着基因链监测仪上的异常波动，瞳孔骤缩：「是虚数议会的「熵寂核心」…… 有人在「∞-7-1」宇宙的废土下重启了它！」
苏晚的战术目镜瞬间切换至废土监控画面，地表裂开的缝隙中涌出灰黑色的能量流，每道能量流都缠绕着机械教廷的齿轮残骸与骸骨帝国的咒文碎片。「能量反应与虚数议会崩塌前完全一致，」她的机械手指在操作台上划出防御矩阵，「但这次的波动里混着克隆体的基因信号和虫族的费洛蒙 —— 像是有人用联邦成员的生物特征破解了封印。」
铁幕皇帝的装甲自动加载「熵寂净化模块」，纳米机器人在他掌心汇聚成双刃剑形态：「三年前我们以为摧毁了所有议会残党，看来漏掉了最危险的棋手。」他调出三年前的战役记录，画面中，虚数议长的核心意识体在崩塌前遁入废土深处，临走前露出的机械笑容里藏着量子加密的讯息，「现在看来，那是「意识转移」的前兆。」
骨潮女王的骸骨舰队在废土上空凝结成乌云，她感知到亡者领域的异常沸腾 —— 被净化的亡者能量正在被逆向转化为熵寂燃料。「他们在挖掘「文明墓碑」，」她的骨冠迸发出警告的红光，「那些刻着联邦先烈名字的墓碑，正被熔炼成新的「熵寂大炮」。」全息影像中，无数骸骨手臂从墓碑下伸出，手中握着用荧光草茎制成的引爆装置。
阿熊的野性共鸣穿透地表，却在接触到地下设施时被反弹回来。它愤怒地捶打地面，震落的泥土中露出刻满虚数符文的金属板，板面上用克隆体的血液写着：「你们的宽容，就是文明的裂痕。」巨熊突然想起三年前在亡者军团战役中救下的克隆体少年，那孩子的眼睛里曾闪过与此刻能量波动相同的阴冷。
林小棠启动「基因溯源」技能，意识体深入废土地底。她看见虚数议长的意识体寄生在一个克隆体少年体内，少年的基因链上缠绕着虫族女王的蜕化甲壳碎片 —— 那是她亲自为受伤虫族幼虫移植的基因片段。「原来如此，」她的声音带着苦涩，「他一直在收集我们的生物特征，用我们的信任作为钥匙，打开封印。」
系统提示音带着末日的丧钟韵律：「文明值 - 1500（信任背叛）」「最高危机：「熵寂核心重启」」「检测到时空裂缝正在生成」。圣物碎片的裂纹中渗出黑色能量，陆辰惊讶地发现，这些能量竟在模仿他的契约纹路，试图接管星舰的控制权。「他想把联邦的力量据为己有，」陆辰握紧碎片，金色光芒与黑色能量在掌心激烈对抗，「就像寄生虫占据宿主的身体。」
虚数议长的投影突然出现在所有联邦通讯频道，他的形态是机械、骸骨、基因的畸形融合体，嘴里吐出的每个字都带着不同文明的音色：「共生联邦？不过是由漏洞百出的生物组建的托儿所。现在，让你们看看真正的秩序 —— 建立在废墟上的永恒统治！」他挥手，废土地表升起十二座「熵寂尖塔」，每座尖塔都连接着不同宇宙的断层空间，尖塔顶端的虚数之眼开始吞噬联邦的跃迁节点。
铁幕皇帝的舰队率先发起攻击，机械炮火在尖塔表面激起黑色烟雾，却发现烟雾落地后竟变成机械教廷的叛乱骑士 —— 那些三年前在圆桌骑士叛乱中「牺牲」的士兵，此刻正用空洞的眼神举起武器。「他们被改造成了「虚数傀儡」，」他的机械臂挡住一记斩击，看见骑士肩甲上的齿轮玫瑰正在吸收熵寂能量，「记忆被篡改，意识被奴役，连曾经的信仰都成了攻击我们的武器。」
苏晚破解了尖塔的能源供给链，发现源头竟是联邦的「文明回收站」—— 那里存放着战争中损毁的机甲与骸骨，本是用于再生的资源，此刻却被逆向转化为熵寂核心的燃料。「我们的「循环共生」理念，被他当成了能量农场，」她的战术目镜映出回收站的惨状，机械残骸与骸骨碎片正在被碾压成黑色淤泥，「而那些负责回收的克隆体工人……」画面切换至工人宿舍，他们的基因链已被改写成虚数议会的服从代码。
骨潮女王带领骸骨舰队俯冲而下，试图用亡者咒文净化傀儡士兵。但当她的咒文触碰到对方的骸骨时，却听见了熟悉的声音 —— 那是「∞-7-17」宇宙的骸骨诗人，曾为联邦的成立献上祝福诗的老者。「对不起，我的女王，」傀儡的 jaw 开合间渗出黑色能量，「他们说，只有毁灭才能让亡者真正安息。」骨潮女王的眼泪滴在老者的骨甲上，却被熵寂能量迅速蒸发。
阿熊在废墟中找到了克隆体少年的藏身之处，却在看见对方眼睛的瞬间愣住 —— 那是他曾救过的孩子，此刻却用匕首抵住自己的咽喉，嘴角挂着虚数议长的笑容：「谢谢你教会我什么是「怜悯」，现在，用你的野性共鸣来为熵寂核心充能吧！」少年割破手腕，血液中流出的不是红色液体，而是带着基因链的黑色能量，能量触须缠住阿熊的熊掌，试图抽取它的生命能量。
林小棠的意识体终于突破层层防御，抵达熵寂核心的控制室。她看见虚数议长的意识体正在吸收核心能量，他的身体膨胀成虚数空间的裂缝形态，每一根血管都连接着联邦成员的痛苦记忆。「你以为自己在创造秩序，」她的基因链化作锁链，缠住议长的能量体，「实则在重复议会曾经的错误 —— 用恐惧统治，终将被恐惧吞噬。」
陆辰赶到时，林小棠的意识体已经开始溃散，圣物碎片的光芒勉强稳住她的形态。他举起共生之剑，剑身上的联邦图腾与熵寂核心的黑暗能量碰撞，激起剧烈的时空震荡。「还记得陈博士的话吗？」他的声音穿透虚数空间，「文明的敌人从来不是外来的威胁，而是拒绝改变的固执。」剑刃刺入核心的瞬间，陆辰看见议长的意识体中闪过一丝动摇，那是对自己千年「秩序」信仰的怀疑。
系统提示音突然变得清澈，如暴雨冲刷后的晴空：「文明值 + 2000（信念坚贞）」「成就解锁：「逆熵挽歌」」「虚数议长共鸣度 45%」。熵寂核心开始崩塌，虚数议长的意识体在光芒中逐渐透明，他最后的目光落在林小棠身上，说出的不是诅咒，而是一句低语：「或许…… 你是对的……」
战斗结束时，废土上空的乌云散去，十二座尖塔化作荧光草的肥料。克隆体少年在阿熊的怀里醒来，看着自己手腕上的共生图腾，眼泪夺眶而出：「对不起…… 我梦见自己变成了怪物……」林小棠轻轻抚摸他的头发，基因共鸣治愈着他体内的虚数创伤：「噩梦已经结束了，现在你安全了。」
圣物碎片重新修复了共生图腾，碎片中央多了一道无法消除的裂痕，却被荧光草藤蔓温柔包裹。陆辰望着废墟上重新生长的荧光草，想起陈博士的日记：「伤痕是文明的勋章，因为它们证明我们曾为守护而战。」林小棠点头，她的基因锁上也多了一道细纹，却在阳光下闪烁着坚韧的光芒。
此刻，在联邦的每个星球上，警报解除的钟声与新生的啼哭同时响起。机械教廷的工程师们开始改造「熵寂尖塔」，将其变为能量回收站；骸骨帝国为牺牲的傀儡士兵建立了「记忆净化墓园」；克隆体联邦启动了「心灵修复计划」，帮助被操控的成员重建信任。而在「贪婪之罪」号星舰上，阿熊正在给克隆体少年讲自己第一次种荧光草的故事，少年的眼中重新泛起了对未来的期待。
传奇阶文明的观测者们在最新报告中写下：「当共生联邦再次从废墟中站起，我们终于理解 —— 他们的强大不在于永不跌倒，而在于每次跌倒都能带着新的感悟重新出发。这种文明韧性，或许才是对抗熵增的终极武器。」而陆辰、林小棠和他们的伙伴们，已经开始为下一次挑战做准备，因为他们知道，在宇宙的长河中，共生文明的旅程永远不会停止，而每一次危机，都将是他们变得更加坚韧的契机。