本堂瑛佑还在讲述他的家庭关系。
“至于我爸爸，我们每年只有过年的时候才能见面，妈妈去世后，我被爸爸接到了大阪生活过一段时间。”
毛利小五郎问道：“现在你和你爸爸没有生活在一起？”
“对，我爸爸去国外工作了，我现在和爸爸的朋友一起住。”
对此毛利小五郎有些意见，父亲一直缺席孩子的成长过程，一看就很不负责任，他可是从来没有缺席过毛利兰的童年生活。
“所以这是你姐姐离家出走的一个原因吗？”
本堂瑛佑只是笑笑没有说话，他不知道他姐姐离家出走的真正原因。
“我爸爸每个月都会寄生活费给我。”
毛利小五郎忙着了解案情，柯南这一次一反常态没有跟着他，而是和毛利兰一起看了本堂瑛佑的亲子手册，确认他是o型血后，才有心思去推理案件。
他也从奥平家女主人公那里侧面印证本堂姐姐给本堂瑛佑输血的事情是真实发生的。
他原以为水无怜奈和本堂瑛佑真没有血缘关系，但是当他看到本堂瑛佑换衣服的裸体时，就发现了一个小细节。
自从这个案件之后，毛利兰他们班级里的人就联系不到本堂瑛佑这个人了，每次打电话都是无人接听。
亚久津仁也特意在群里询问其他人本堂瑛佑之后的情况，知晓他没有危险后期也会接受FbI的证人保护计划后，就不再关注这件事。
亚久津仁对于本堂瑛佑的特别关心，也只是因为他和小学弟有几分相似，如今确保他不会出现什么问题，并且即将下线后，他就不再关注了。
然而柯南听到这件事的态度和他截然相反，他从毛利兰那里知道本堂瑛佑失踪了，而且最后一次见面他还留下一段模棱两可的话后，心里异常的焦灼。
本堂瑛佑告诉毛利兰他爸爸的同事找到他，说要带着他一起去寻找他的姐姐，又提到了杯户中央医院。
柯南生怕这是组织的阴谋，将茱蒂约好在阿笠博士家见面讨论一下这件事情。
“你们说的那位和水无怜奈长得很像的孩子在年底前确实拿着照片来医院找过他姐姐。只不过护士们都没见过水无怜奈，他没有收获。”
柯南想要知道的并不是这些内容，而是本堂瑛佑被他父亲同事在医院碰到的事情。
阿笠博士听到他们左一个pany，右一个pany的，意识到这个pany不是一个普通的公司。
灰原哀对于国外的情报组织还是有一定了解的，“是cIA。”
“什么？本堂瑛佑的爸爸是cIA的间谍？”
“是的，他爸爸原名是伊森本堂，之前被派出去执行任务。”
柯南知道了伊森本堂的身份，心中的大石头落地，“看来本堂瑛佑是被他爸爸找同事保护了起来。”
知道事情真相的茱蒂却还是一脸凝重，“不，伊森本堂早在四年前就已经因公殉职了。他的尸体是在某个仓库里找到的。
据当时的流浪汉所说他是被一个枪声惊醒地，他偷偷摸摸跑过去，就看到一个男人倒在血泊中，身边跪着一个女人，还有两个穿着一身黑的男人，其中一个男人长发飘飘，另一个带着一副黑框眼镜。”
“琴酒和伏特加。”
“从流浪汉的描述来看的确符合他们两个人的外貌，当时应该是女人用牙齿咬伤伊森本堂的手腕，然后用枪杀害了他，之后就跟着琴酒和伏特加回去了。
过了一段时间，就有人跑向血泊中的男人叫他伊森。”
如此看来本堂瑛佑的父亲伊森本堂之前也在组织当卧底。
灰原哀感到不可思议，“他们两个目击证人竟然还活着！”
茱蒂摇了摇头，回答道：“不，后面跑进来的人被组织埋伏在暗处的人一枪毙命，流浪汉没有被发现踪迹，他侥幸从大火里逃出，躲过一劫难。这些都是赤井确认无误传回来的消息。”
灰原哀听到一场大火烧毁了仓库，觉得这才对味，组织做事一向是这样。不会留下痕迹。
从流浪汉口中得知，那个跪着的女人的长相和水无怜奈一模一样。
“会不会组织对伊森本堂的身份产生了怀疑，安排水无怜奈整容成伊森本堂女儿的模样，让她接近伊森本堂打探消息，谁知被伊森本堂拆穿，到最后还是因为某些原因被水无怜奈反杀？”
因为他们都不是当事人无法确定真相是不是和灰原哀猜测的那个样子。
“哎，现在水无怜奈还没有清醒，我们都没有办法从她那里打听消息，她昏迷地越久，情况越不利。”
在场的人都明白茱蒂的顾虑，他们都知道黑衣组织是有多可怕。
黑衣组织不只是有代号成员，他们还有许多边缘性的成员，根本不知道哪些人会是组织的人。
医院里的病人很多，他们不可能一一进行排查。
柯南突然提议：“我们先去杯户医院看一看吧。”
“为什么？”
“我们现在知道cIA在医院也有安插眼线，那我这样的生面孔会比你们更有用，不是吗？”
茱蒂被他说服，带着柯南一起赶往医院，顺便将之前和本堂瑛佑有过接触的护士约出来。
他们虽然是觉得本堂瑛佑被cIA保护起来了，但还是确认一遍为好。
柯南将之前收集到的信息一一汇总，他忽然发现一个盲点。
本堂瑛佑应该是没有见过伊森本堂的同事，他是怎么认出cIA探员的？
他连忙打电话给毛利兰询问当时的具体情况。
“对，瑛佑是说他见到了他爸爸公司的同事。”
“他有见到那个人？”
“不是，他说实在杯户医院里有人输入了一个他爸爸寄给他的工作伙伴邮件时相同的电子邮箱。”
“他没见过那人，为什么会知道电子邮箱？”
“因为声音啊，他说他爸爸之前在国外工作和他通话时，他有从背景声音中听到一串很像音乐旋律的按键声，像是童谣的旋律。”